防水排蓄水系统
进入施工程序后，首先要检查屋顶原有防水情况，这一步非常关键，也是施工的难点。如果施工完毕才发现渗水漏水，补救起来非常困难，且无形中增加了施工成本。清扫干净屋顶，封堵排水口，屋顶灌水10厘米做48小时闭水试验，检查无漏水情况后才可进入施工。
耐根穿刺防水层
屋顶绿化植物的根系若不采用阻拦的措施，会对屋顶的结构造成一定的伤害。即使是在仅有防水层或包括压制层的屋面上，由于空气的流动作用导致一些植物的种子飘落屋面上，在一定的条件下，植物也能顽强的生长。其后果导致其根系穿透防水层，甚至结构层，从而使整个屋面系统失去作用。
耐根穿刺防水层主要材料为HDPE膜。
排蓄水层
通常原始屋顶是通过屋顶面找坡排水的形式，将雨水引至排水口，屋面做防水层。在屋顶花园设计以后如果不采取专业处理，屋面的雨水无法快速地从排水口排出，将导致屋顶积水、植物根系破坏防水层导致漏水，屋顶植物淹死等问题。
所以我们做屋顶绿化设计时要考虑到屋顶有组织排水，屋顶和种植土之间需要铺设屋顶花园专用排水板，屋顶花园专用排水板不妨碍屋顶自由排水，且有部分蓄水功能，保持屋顶植物的水分（从下往上做法为：屋顶结构-防水板-无纺布一层-5~10cm厚中粗砂-适当厚度的轻质种植土-屋顶植物）。实际工程中屋顶花园专用排水板已经得到广泛的运用，它的效果也得到了实践的考验。
为了更好地观察排水情况，在排水口处可以设置检查口。检查口一般为加盖的正方形小铁皮箱。如果是侧面排水口，检查口则安置于距离排水口10厘米的蓄排水盘上方处；如果是屋顶地面排水口，则在隔根层排水口位置预留出下水口，蓄排水盘置于排水口正上方，检查口直接放置于蓄排水盘上方，周围用鹅卵石固定。浇水时，从检查口观察水灌满蓄排水盘并溢出，判断水已浇足，可以停止浇水，这样既节能又方便检修排水口。
一般由排蓄水板，陶粒和排水管组成。主要结构为排蓄水盘。排蓄水盘一般是由凹凸两面组成，其中一面带有小孔，铺设时带小孔面朝上，小孔既可以从屋顶向上排气，又可以向下排出多余水分，剩余水分储存在排蓄水盘的凹面里，起到一定的保水作用。各个排蓄水盘之间连接可以直接搭边或者凹凸相扣铺设。
对屋顶绿化施工的验收应重点放在保护层的防水性能和根的防护性能上。检测的方法有积水法、喷灌法、烟气法、外观检测法等。
过滤层
过滤层设于排蓄水盘与基质之间，过滤层无纺布应空铺于排（蓄）水层之上，铺设平整、无皱折，搭接宽度不应小于150 毫米，边缘沿种植挡墙上翻至与种植基质高度一致。其作用是为了防止基质直接倒入而导致排蓄水盘小孔堵塞。
